MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 114

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187113	GGC	2	6	910	915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NT_187113	TGA	2	6	971	976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187113	TG	3	6	3909	3914	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187113	ACC	3	9	3916	3924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NT_187113	CG	3	6	3930	3935	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NT_187113	CCAGA	2	10	3949	3958	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NT_187113	AAT	2	6	8389	8394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187113	TTA	2	6	8959	8964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187113	CTTTT	2	10	8970	8979	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NT_187113	CTG	2	6	10819	10824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NT_187113	TTA	2	6	10830	10835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187113	TGA	2	6	11221	11226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187113	TGCAAA	2	12	15472	15483	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NT_187113	TAT	2	6	15493	15498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187113	CAG	2	6	15513	15518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NT_187113	AAT	2	6	15523	15528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187113	T	7	7	15764	15770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187113	GCA	2	6	15786	15791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NT_187113	GCC	2	6	15798	15803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NT_187113	GCC	2	6	15809	15814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NT_187113	TAA	2	6	15820	15825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187113	A	6	6	15824	15829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187113	TTA	2	6	17071	17076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187113	GGT	2	6	17087	17092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NT_187113	ACC	2	6	17646	17651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NT_187113	TG	3	6	17919	17924	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NT_187113	AAC	2	6	17930	17935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NT_187113	A	6	6	18002	18007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NT_187113	TGA	2	6	18020	18025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NT_187113	GC	3	6	18073	18078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NT_187113	CGCTC	2	10	18117	18126	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
32	NT_187113	GCC	2	6	18136	18141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NT_187113	AT	3	6	18216	18221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187113	TC	3	6	19586	19591	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NT_187113	CGC	2	6	19614	19619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NT_187113	TGT	2	6	19668	19673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NT_187113	CCA	3	9	20573	20581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NT_187113	ATC	2	6	20599	20604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NT_187113	T	6	6	21871	21876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187113	AAT	2	6	21927	21932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187113	A	6	6	24225	24230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187113	T	6	6	25949	25954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NT_187113	CAA	2	6	25977	25982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NT_187113	TGA	2	6	26019	26024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187113	TAT	2	6	26031	26036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187113	TGA	2	6	26449	26454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NT_187113	TCA	2	6	26463	26468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NT_187113	ATA	2	6	27346	27351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NT_187113	A	8	8	27368	27375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NT_187113	AGAT	2	8	27430	27437	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187113	TCA	2	6	27447	27452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NT_187113	T	6	6	27994	27999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NT_187113	CATG	2	8	28042	28049	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NT_187113	AT	3	6	28058	28063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NT_187113	AATA	2	8	28091	28098	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NT_187113	CCACA	2	10	28099	28108	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
57	NT_187113	AT	3	6	28115	28120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187113	A	6	6	28130	28135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NT_187113	GTT	2	6	28294	28299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NT_187113	T	7	7	28387	28393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187113	ATC	2	6	28402	28407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NT_187113	A	6	6	28433	28438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NT_187113	A	6	6	28484	28489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NT_187113	TC	3	6	28511	28516	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NT_187113	ATG	2	6	28517	28522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NT_187113	CGT	2	6	28557	28562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NT_187113	TTAA	2	8	28568	28575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NT_187113	A	6	6	40084	40089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187113	ACG	2	6	40102	40107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NT_187113	CAA	2	6	40115	40120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NT_187113	AAG	2	6	44917	44922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NT_187113	CTTAC	2	10	44961	44970	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NT_187113	A	7	7	45054	45060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NT_187113	ACG	2	6	45070	45075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NT_187113	AGC	2	6	45089	45094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NT_187113	TAA	2	6	45096	45101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NT_187113	CT	3	6	45115	45120	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NT_187113	AG	3	6	45151	45156	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NT_187113	CG	3	6	45175	45180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NT_187113	CCTG	2	8	45186	45193	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NT_187113	GTCC	2	8	45238	45245	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NT_187113	GACT	2	8	45268	45275	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NT_187113	GTA	2	6	45282	45287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NT_187113	CCA	2	6	45333	45338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NT_187113	CTA	2	6	45368	45373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NT_187113	T	6	6	45401	45406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NT_187113	GCC	2	6	45416	45421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NT_187113	CCTG	2	8	45584	45591	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NT_187113	CAG	2	6	45694	45699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NT_187113	CTT	2	6	45702	45707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NT_187113	AGC	2	6	45772	45777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NT_187113	CTAT	2	8	45785	45792	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NT_187113	TCC	2	6	45814	45819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NT_187113	T	6	6	45843	45848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NT_187113	TCT	2	6	46060	46065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NT_187113	TTC	2	6	46141	46146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NT_187113	ATT	2	6	46267	46272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NT_187113	CGA	2	6	46319	46324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NT_187113	AAT	2	6	46335	46340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NT_187113	AT	3	6	46406	46411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NT_187113	TGAA	2	8	46422	46429	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NT_187113	AAAT	2	8	46462	46469	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NT_187113	T	6	6	48067	48072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NT_187113	GTC	2	6	48155	48160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NT_187113	GC	3	6	48193	48198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NT_187113	TA	3	6	48204	48209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NT_187113	T	6	6	48225	48230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NT_187113	TTTA	2	8	48273	48280	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NT_187113	ATCC	2	8	48311	48318	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NT_187113	TGT	2	6	48319	48324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NT_187113	GAA	2	6	48933	48938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NT_187113	AAG	2	6	49054	49059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NT_187113	GTTC	2	8	49062	49069	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NT_187113	TAC	2	6	49133	49138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.